Félicitations à Maud Fiard (MIO-MEB) qui a soutienu sa thèse le mercredi 14 Décembre 2022

Sur le sujet suivant : 

"Indicateurs microbiens de l'état fonctionnel des mangroves en outre mer :
application à la directive cadre sur l'eau"
 

Directeur de these : M. Philippe CUNY, professeur  Aix-Marseille Université

Co-Directeur de these :  Mme Cécile MILITON Aix-Marseille Université
Rapporteur Mme Cristiana CRAVO-LAUREAU Université de Pau et des pays de l'Adour
Rapporteur M. Pierre-Alain MARON INRAE
Examinateur Mme Claire GOLLéTY CUFR-MAYOTTE
Examinateur Mme Valérie MICHOTEY Aix-Marseille Université

Résumé de la thèse

Les mangroves sont des écosystèmes forestiers situés à l’interface entre terre et mer. De par leur localisation, ces forêts maritimes sont soumises aux variations de qualité des eaux côtières en relation avec les pressions liées aux activités humaines à proximité. Présentes dans la zone intertidale de dix territoires ultramarins, les mangroves et les organismes qui y vivent constituent donc des composantes intéressantes pour témoigner de la qualité des masses d’eau dans le cadre de la mise en place de la Directive européenne Cadre sur l’Eau (DCE) en Outremer. Dans le but de valider la pertinence de l’utilisation de ces forêts comme écosystème sentinelle, le projet « DCE mangroves » a investigué au sein d’un gradient d’anthropisation différents compartiments biologiques de mangroves afin d’améliorer la connaissance de sa biodiversité et de son fonctionnement. Ainsi, ce travail de thèse a eu pour objectif de caractériser les communautés bactériennes et archéennes benthiques (biomasse moléculaire, abondance, diversité et composition) de mangroves afin (i) d’enrichir nos connaissances sur ces organismes clés pour cet écosystème, (ii) de comprendre quels sont les paramètres qui façonnent la structure de ces communautés et (iii) de proposer des bioindicateurs potentiels des pressions anthropiques identifiées dans les mangroves ultra-marines étudiées. Les résultats obtenus ont permis (i) d’identifier les approches moléculaires adéquates pour la description des microbiotes benthiques en mangrove, (ii) de caractériser finement des pressions anthropiques dans plusieurs stations de mangroves en Guyane et Martinique, (iii) de compléter le référentiel sur la biodiversité taxonomiques des microbiotes des mangroves françaises et (iv) d’identifier des taxons microbiens candidats pour être des bioindicateurs de la dégradation de l’écosystème mangrove. Les résultats obtenus sur le compartiment microbien des mangroves françaises constituent un socle pour la construction d’un indicateur utilisable pour déterminer la qualité des eaux côtières et de transition dans les outre-mer françaises.